山口 拓実 (YAMAGUCHI, Takumi)准教授
マテリアルサイエンス系, 生命機能工学領域
◆学位
博士(工学) 東京大学大学院
◆職歴
2015 - : 北陸先端科学技術大学院大学 , 准教授
2008 - 2015 : 分子科学研究所 , 助教
◆専門分野
生物分子化学, 生体化学, 生物有機化学, 構造有機化学、物理有機化学
◆研究キーワード
分子シミュレーション, 糖鎖, 分子認識, NMR, 超分子化学
◆研究課題
糖鎖の構造・機能解明
私たちは化学的な手法を基盤にした多角的な実験を展開し、糖鎖研究に挑んでいます。糖鎖に構造情報取得の ための化学プローブを導入することで、分子分光法による計測と分子シミュレーションを活用した立体構造解析 を可能とし、水中で揺らめく糖鎖の姿を描き出すことに成功しました。さらに、細胞表面を覆う糖鎖を模倣した モデル化合物の合成や、糖鎖を応用した細胞機能の制御にも挑戦しています。 備考

■研究業績

◆発表論文
Solid-state 17O NMR analysis of synthetically 17O-enriched d-glucosamine
Kazuhiko Yamada, Yoshiki Yamaguchi, Yoshinori Uekusa, Kazumasa Aoki, Ichio Shimada, Takumi Yamaguchi, Koichi Kato
Chemical Physics Letters, 749, 137455-137455, 2020
Remodeling of the Oligosaccharide Conformational Space in the Prebound State To Improve Lectin-Binding Affinity
Tatsuya Suzuki, Saeko Yanaka, Tokio Watanabe, Gengwei Yan, Tadashi Satoh, Hirokazu Yagi, Takumi Yamaguchi, Koichi Kato
Biochemistry, -, 2019
Dynamic Views of the Fc Region of Immunoglobulin G Provided by Experimental and Computational Observations.
Saeko Yanaka, Rina Yogo, Rintaro Inoue, Masaaki Sugiyama, Satoru G Itoh, Hisashi Okumura, Yohei Miyanoiri, Hirokazu Yagi, Tadashi Satoh, Takumi Yamaguchi, Koichi Kato
Antibodies (Basel, Switzerland), 8, 3, -, 2019
レクチン-糖鎖相互作用の物理化学的理解 核磁気共鳴分光法と分子動力学計算を通じて観る糖鎖の動的構造とレクチンの糖鎖認識の理解
矢木 宏和, 鈴木 達哉, 谷中 冴子, 山口 拓実, 加藤 晃一
医学のあゆみ, 269, 9, 761-767, 2019
◆Misc
Molecular dynamics of gangliosides
Takumi Yamaguchi, Koichi Kato
Methods in Molecular Biology, 1804, 411-417, 2018
NMR characterization of the conformations, dynamics, and interactions of glycosphingolipids
M. Yagi-Utsumi, T. Yamaguchi, Y. Uekusa, K. Kato
NMR in Glycoscience and Glycotechnology (K. Kato and T. Peters eds), RSC Publishing, 161-178, 2018
NMR explorations of biomolecular systems with rapid conformational exchanges
Maho Yagi-Utsumi, Takumi Yamaguchi, Ryo Kitahara, Koichi Kato
Molecular Science of Fluctuations Toward Biological Functions, 87-103, 2016
Paramagnetism-assisted nuclear magnetic resonance analysis of dynamic conformations and interactions of oligosaccharides
Takumi Yamaguchi, Koichi Kato
Glycoscience: Biology and Medicine, 1, 137-145, 2015
NMR
山口拓実, 加藤晃一
糖鎖の新機能開発・応用ハンドブック, エヌ・ティー・エス, 265-271, 2015
◆書籍
NMR characterization of the conformations, dynamics, and interactions of glycosphingolipids in NMR in Glycoscience and Glycotechnology
161-178, RSC Publishing (Cambridge), 2017
NMR Characterization of the Dynamic Conformations of Oligosaccharides in Modern Magnetic Resonance
Springer, pp 737-754, 2018, 2017
NMR explorations of biomolecular systems with rapid conformational exchanges in Molecular Science of Fluctuations toward Biological Functions
87-103, Springer, 2016
「NMR」, 糖鎖の新機能開発・応用ハンドブック~創薬・医療から食品開発まで~
265-271, エヌ・ティー・エス, 2015
◆講演・口頭発表
常磁性NMR計測を活用した糖鎖の動的立体構造解析法の開発
第38回日本糖質学会年会, 2019
糖鎖コンフォメーション空間の改変による糖−タンパク質間相互作用の制御
第17回ホスト-ゲスト・超分子化学シンポジウム, 2019
Exploration and remodeling of the dynamic conformations of biofunctional oligosaccharides
JAIST Japan-India Symposium on Advanced Science 2019, 2019
糖鎖コンフォメーション空間の探査と化学的改変
第12回バイオ関連化学シンポジウム, 大阪大学(吹田), 2018
常磁性効果を活用した糖鎖の動的構造解析
第19回若手NMR研究会, グリーンピア瀬戸内(呉), 2018

■担当講義

Analysis of Nano-Materials with Training Course, Advanced Biomolecular Science (E), Evaluation of Properties of Materials, Bioscience and Biotechnology(E), ナノ分子解析論(実習付), 先端生体分子科学特論(E), 物性評価特論, 生命機能工学特論(E)

■学外活動

◆所属学会
日本核磁気共鳴学会, 日本糖質学会, 日本化学会

■賞等

・ 日本糖質学会奨励賞 , 山口 拓実 , 2019
・ 自然科学研究機構若手研究者賞 , 山口 拓実 , 2014
・ バイオ関連化学シンポジウム講演賞 , 山口 拓実 , 2013