・ PKC 2024 Test of Time Award , Eiichiro Fujisaki, Koutarou Suzuki , International Association for Cryptologic Research , 2024
・ Best Paper Award , Kazuki Yamamura, Yuntao Wang, Eiichiro Fujisaki , International Conference on Information Security and Cryptology , 2021
・ IEICE Paper of the Year , Kaisei Kajita, Kazuto Ogawa, Eiichiro Fujisaki , The Institute of Electronics, Information and Communication Engineers , 2021
・ The IEICE Achievement Award , Eiichiro Fujisaki, Tatsuaki Okamoto , The Institute of Electronics, Information and Communication Engineers , 2020
・ PKC 2019 Test of Time Award , Eiichiro Fujisaki, Tatsuaki Okamoto , International Association for Cryptologic Research , 2019
・ 基礎・境界ソサエティ功労賞 , 藤崎英一郎 , 電子情報通信学会 , 2016
・ 暗号と情報セキュリティシンポジウムSCIS論文賞 , 藤崎英一郎 , 電子情報通信学会 , 2002
・ 日経BP技術賞 , 岡本龍明, 藤崎英一郎, 森田光 , 日経BP社 , 2000
・ 平成５年度学術奨励賞 , 藤崎英一郎 , 電子情報通信学会 , 1994