・ PKC 2024 Test of Time Award , 藤﨑英一郎, 鈴木幸太郎 , International Association for Cryptologic Research , 2024
・ Best Paper Award , 山村和輝, Wang, Yuntao, 藤﨑英一郎 , International Conference on Information Security and Cryptology , 2021
・ 論文賞 , 梶田海成, 小川一人, 藤﨑英一郎 , 電子情報通信学会 , 2021
・ 業績賞 , 藤﨑英一郎, 岡本龍明 , 電子情報通信学会 , 2020
・ PKC 2019 Test of Time Award , 藤﨑英一郎, 岡本龍明 , International Association for Cryptologic Research , 2019
・ 基礎・境界ソサエティ功労賞 , 藤崎英一郎 , 電子情報通信学会 , 2016
・ 暗号と情報セキュリティシンポジウムSCIS論文賞 , 藤崎英一郎 , 電子情報通信学会 , 2002
・ 日経BP技術賞 , 岡本龍明, 藤崎英一郎, 森田光 , 日経BP社 , 2000
・ 平成５年度学術奨励賞 , 藤崎英一郎 , 電子情報通信学会 , 1994