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島原 秀登 (SHIMAHARA, Hideto)助教
マテリアルサイエンス系, ナノマテリアルテクノロジーセンター

発表論文

42件
・ 生体高分子の触媒科学-金属含有蛋白質のプロトン輸送の機構解明- , 島原秀登,Muhamad Koyimatu,杉森公一,長尾秀実 , 北陸先端科学技術大学院大学 共有計算サーバ使用成果報告 , 34 出版年
・ Approach to Structure-Based Drug Discovery on Molecular Biology. , Shimahara H , Mol Biol , 4 , 1 , e121 出版年
・ An Approach to Water Molecule Dynamics Associated with Motion of Catalytic Moiety , Hideto Shimahara, Kimikazu Sugimori, Muhmad Koyimatu, Hidemi Nagao, Tadayasu Ohkubo, and Yuji Kobayashi , AIP Conf. Proc. http://dx.doi.org/10.1063/1.4794643 http://scitation.aip.org/content/aip/proceeding/aipcp/10.1063/1.4794643 , 1518 , 610-613 出版年
・ Theoretical Model for Assessing Properties of Local Structures in Metalloprotein , M. Koyimatu, H. Shimahara*, M. Iwayama, K. Sugimori, K. Kawaguchi, H. Saito, and H. Nagao* (*co-correspondence) , AIP Conf. Proc. , 1518 , 626-629 出版年
・ Nucleosome Structural Changes Induced by Binding of Non-histone Chromosomal Proteins HMGN1 and HMGN2 , Hideto Shimahara*, Takaaki Hirano, Kouichi Ohya, Shun Matsuta, Sailaja S. Seeram, and Shin-ichi Tate , FEBS Open Bio, http://dx.doi.org/10.1016/j.fob.2013.03.002 (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3668530) , 3 , 184-191 出版年
・ 計算・実験科学両手法を用いた創薬利用ヒスチジン解析技術の開発及び CO2捕捉・貯蔵法の開発-QM・NMR 法を用いて炭酸脱水酵素活性部位の水素結合ネットワークで起こるプロトン輸送を読み解く- , 島原秀登 , 北陸先端科学技術大学院大学共有計算サーバ使用成果報告2012 , pp. 29-30 出版年
・ Theoretical Study of a π-stacking Interaction in Carbonic Anhydrase. , Muhamad Koyimatu, Hideto Shimahara, and Hidemi Nagao , Technical memorandum (School of Information Science, Japan Advanced Institute of Science and Technology), 2013 , pp. 31-32 出版年
・ Theoretical Study of p-stacking Interaction in Carbonic Anhydrase , M. Koyimatu, H. Shimahara, K. Kawaguchi, H. Saito, and H. Nagao , International Symposium on Computational Science , 4 pages 出版年
・ Π-stacking Interaction between Heterocyclic Rings in a Reaction Field of Biological System , Muhamad KOYIMATU, Hideto SHIMAHARA, Kimikazu SUGIMORI, Kazutomo KAWAGUCHI, Hiroaki SAITO, and Hidemi NAGAO , The 12th Asia Pacific Physics Conference of the Association of Asia Pacific Physical Societies , accepted , 4 pages 出版年
・ 炭酸脱水酵素の反応機構を利用した二酸化炭素水和触媒の開発 , 島原秀登 , JAIST-VBL教育・研究活動報告書2011-北陸先端科学技術大学院大学 出版年
・ 去勢抵抗性前立腺がん治療をめぐる新薬開発競争:構造基盤阻害剤設計に布石 , 島原秀登 , ファルマシア , 49 , 1 , 67 出版年
・ Theoretical Calculation for Proton Transfer in Biological System-Clarification of Catalytic Mechanism of Enzyme- , Hideto Shimahara , 北陸先端科学技術大学院大学 共有計算サーバ使用成果報告 2011 , 45-46 出版年
・ Assembly states of the nucleosome assembly protein 1 (NAP-1) revealed by sedimentation velocity and non-denaturing mass spectrometry , Masanori Noda, Susumu Uchiyama, Adam R. McKay, Akihiro Morimoto, Shigeki Misawa, Akihiro Yoshida, Hideto Shimahara, Hiroto Takinowaki, Shota Nakamura, Yuji Kobayashi, Sachihiro Matsunaga, Tadayasu Ohkubo, Carol V Robinson, Kiichi Fukui , Biochemical Journal , 436 , 1 , 101-12 出版年
・ 支部だより-研究テーマ- , 島原秀登 , 生物物理学会誌 , 51 , 1 , 48-9 出版年
・ 生物系のプロトントランスファに関する理論的解析 -酵素触媒機構の解明- , 島原秀登 , 北陸先端科学技術大学院大学 共有計算サーバ使用成果報告2010 , 37 出版年
・ 量子化学的手法を用いた炭酸脱水酵素の触媒反応におけるプロトントランスファのメカニズムの解析 , 島原秀登,杉森公一,吉田卓也,長尾秀実,中沢隆,大久保忠恭,小林祐次 , Japanese Journal of the Carbobnic Anhydrase Research , 1 , 6 , 65 出版年
・ 北陸の研究たより-二酸化炭素水和触媒の開発- , 島原秀登 , HIAC NEWS , 79 , 14 出版年
・ NMR・MM法による炭酸脱水酵素機能に重要なHis残基の挙動解析と触媒機構解明 , 島原秀登 , 科学研究費補助事業研究成果報告書 出版年
・ 生物系のプロトントランスファに関する理論的解析 -酵素触媒機構の解明- , 島原秀登 , 北陸先端科学技術大学院大学 共有計算サーバ使用成果報告2009 , 27 出版年
・ 生物系のプロトントランスファ , 島原秀登, 長尾秀実 , 化学 , 63 , 64-65 出版年
・ Tautomerism of histidine 64 associated with proton transfer in catalysis of Carbonic Anhydrase , Hideto Shimahara, Takuya Yoshida, Kimiichi Sugimori, Ayumu Sugiyama, Taku Mizukami, Hidemi Nagao, Takashi Nakazawa, Tadayasu Ohkubo, Yuji Kobayashi , FASEB J. , 22 , 611.23 出版年
・ Review "Catalytic Mechanism of Carbonic Anhydrase" , Hideto Shimahara , Japanese Journal of the Carbobnic Anhydrase Research (JpnJCAR,日本炭酸脱水酵素研究雑誌) , 1 , 39-49 出版年
・ 生物系のプロトントランスファに関する理論的解析 -酵素触媒機構の解明- , 島原秀登 , 北陸先端科学技術大学院大学 共有計算サーバ使用成果報告2008 出版年
・ 生物系のプロトントランスファに関する理論的解析 -酵素触媒機構の解明- , 島原秀登 , 北陸先端科学技術大学院大学 共有計算サーバ使用成果報告2007 , 18-19 出版年
・ Tautomerism of histidine 64 associated with proton-transfer in catalysis of carbonic anhydrase. , Shimahara H, Yoshida T, Shibata Y, Shimizu M, Kyogoku Y, Sakiyama F, Nakazawa T, Tate SI, Ohki SY, Kato T, Moriyama H, Kishida KI, Tano Y, Ohkubo T, Kobayashi Y. , J. Biol. Chem. , 282 , 13 , 9646-56 出版年
・ Free Energy Calculation of Docking Structure of Azurin(I)-Cyto- chrome c551(III) Complex Systems by using the Energetic Representation , Nishikawa K, Yamamoto T, Sugiyama A, Purqon A, Mizukami T, Shimahara H, *Nagao H, Nishikawa K , AIP Conference Proceedings , 982 , 2008 , 780-783 出版年
・ Theoretical Study of Free Energy in Docking Stability of Azurin(II)-Cytochrome c551(II) Complex System , Yamamoto T, Nishikawa K, Sugiyama A, Purqon A, Mizukami T, Shimahara H, *Nagao H, Nishikawa K , AIP Conference Proceedings , 982 , 2008 , 784-787 出版年
・ Distinct DNA methylation activity of Dnmt3a and Dnmt3b towords naked and nucleosomal DNA , Hideyuki Takeshima, Isao Suetake, Hideto Shimahara, Kiyoe Ura, Shin-ichi Tate, and Shoji Tajima , J Biochem. , 139 , 3 , 503-15 出版年
・ Al(3+) interaction sites of calmodulin and the Al(3+) effect on target binding of calmodulin. , Kurita H, Nakatomi A, Shimahara H, Yazawa M, Ohki SY. , Biochem Biophys Res Commun. , 333 , 1060-5 出版年
・ Assembly and Disassembly of Nucleosome Core Particles Containing Histone Variants by Human Nucleosome Assembly Protein I , Mitsuru Okuwaki, Kohsuke Kato, Hideto Shimahara, Shin-ichi Tate, and Kyosuke Nagata , Mol Cel Biol. , 25 , 10639-10651 出版年
・ Molecular-orientation analysis based on alignment-induced TROSY chemical shift changes. , Tate S, Shimahara H, Utsunomiya-Tate N. , J Magn Reson. , 171 , 284-92. 出版年
・ Development of Support Tool for NMR Spectrum Analysis. , Shouji Tatsumoto, Kenji Satou, Akihiko Konagaya, Jun'ichi Kurita, Hideto Shimahara, Shin-ichi Tate , METMBS , 159-164 出版年
・ Measurement of 15N chemical shift anisotropy in a protein dissolved in a dilute liquid crystalline medium with the application of magic angle sample spinning. , Kurita J, Shimahara H, Utsunomiya-Tate N, Tate S. , J Magn Reson. , 163 , 163-73 出版年
・ Solution structure of the ribosome recycling factor from Aquifex aeolicus. , Yoshida T, Uchiyama S, Nakano H, Kashimori H, Kijima H, Ohshima T, Saihara Y, Ishino T, Shimahara H, Yoshida T, Yokose K, Ohkubo T, Kaji A, Kobayashi Y. , Biochemistry , 40 , 2387-96 出版年
・ Stabilization of Pseudomonas aeruginosa cytochrome c(551) by systematic amino acid substitutions based on the structure of thermophilic Hydrogenobacter thermophilus cytochrome c(552). , Hasegawa J, Shimahara H, Mizutani M, Uchiyama S, Arai H, Ishii M, Kobayashi Y, Ferguson SJ, Sambongi Y, Igarashi Y , J Biol Chem. , 274 , 37533-7 出版年
・ Backbone NMR assignment and secondary structure of ribosome recycling factor (RRF) from Pseudomonas aeruginosa. , Kashimori H, Yoshida T, Kijima H, Shimahara H, Uchiyama S, Ishino T, Shuda M, Nakano H, Shibata Y, Saihara Y, Ohkubo T, Yoshida T, Kaji A, Kobayashi Y , J Biomol NMR. , 15 , 341-2 出版年
・ ヒスチジンのNMR-酵素の触媒機構解明に威力 , 島原秀登, 小林祐次 , 化学 , 53 , 74-75 出版年
・ 炭酸脱水酵素の触媒機構解明にむけて -NMRによるヒスチジン残基の解析- , 島原秀登, 小林祐次 , 日本応用酵素協会誌 , 33 , 28-38 出版年
・ NMR Spectrum for Clarification of Histidine Tautomerism in Protein --The Function of His64 in Carbonic Anhydrase-- , 島原秀登, 小林祐次, , 生産技術誌 , 49 , 48-51 出版年
・ Spectrum of in vivo hprt mutations in T lymphocytes from atomic bomb survivors. I. Sequence alterations in cDNA. , Shimahara H, Kato T, Hirai Y, Akiyama M , Carcinogenesis. , 16 , 583-91 出版年
・ Conformational Analysis of Single-Chained Monelline , Y.Kobayashi,K.Miyazaki,T.Yoshida,H.Shimahara,Y.Kyougoku,S.J.Lee,H.Iijima,and P.A.Temussi , Proceedings of 14th American Peptide Symposium 出版年
・ NMR approach of His64 in carbonic anhydrase using a 13C and 15N double-labeling technique , H. Shimahara, T. Yoshida, M. Shimizu, Y. Kyougoku, F. Sakiyama, T. Kato, H. Moriyama, K. Kishida, Y. Tano and Y. Kobayashi , Protein Engineering , 8 , 951 出版年